新一代测序*Illumina宣布将拓展到医学诊断领域。这家公司表示,它已组建了一个名为Grail的公司,希望利用Illumina的测序技术来实现癌症筛查,直接检测血液中的循环核酸。
这样的检测有时被称为“液体活检(liquid biopsies)”,主要有两种形式。Grail检测的是循环肿瘤DNA(ctDNA)。另外一些人希望通过完整的细胞来诊断疾病和评估预后和疗效,这些细胞被称为循环肿瘤细胞(CTC)。
CTC就像矿井中的金丝雀,警告着肿瘤的存在和分子特征,而此时疾病可能还没有症状。据Janssen Diagnostics的研发主管Ron Mazumder介绍,它们的丰度与病人预后密切相关。“对于转移性乳腺癌、结肠直肠癌和前列腺癌,你可以根据CTC的数量将病人分为预后较好或较差的。”
然而,找到它们谈何容易,CTC是极其的。MilliporeSigma(Millipore与Sigma-Aldrich合并而成)的科学家Brian Hall表示:“在1 ml血液中,大约有700万个白细胞和10个CTC,这真的是大海捞针。”当然,CTC的确切数量因病人而异,也随着疾病进程和治疗而改变。
为此,研究人员和各家公司设计出几种策略来帮助你捞针1。
正选和负选
由于CTC如此,大多数的CTC分析工具都采用两种基本策略之一。在正选方法中,CTC是利用磁珠偶联的抗体来浓缩的,这些抗体针对已知的CTC抗原。例如,Janssen Diagnostics的CellSearch检测就利用了许多上皮性肿瘤都表达EpCAM的现象来富集CTC,这种检测已被美国FDA批准。之后用DAPI和细胞角蛋白对分离出的细胞进行染色,以确保它们是CTC,并通过白细胞标志物CD45复染,确定它们不是白细胞。
负选策略则利用抗体来去除那些不是CTC的细胞,例如,表达CD45的。对于某些肿瘤而言,这种策略可能更优,因为不依赖所表达的CTC抗原。
据美天旎的肿瘤学研究Olaf Hardt介绍,这两种策略都不能地回收CTC。细胞聚集成团,因此在负选过程中可能将宝贵的CTC与洗澡水一起倒掉。同理,正选策略也不可避免地会保留一些非CTC。因此,研究人员经常将正选与负选相结合,在下游分析中配对使用,如显微镜和流式细胞仪。
当然,这些策略依赖于生物标志物的鉴定,这些标志物定义了感兴趣的CTC。并非所有CTC都是EpCAM阳性的,非上皮性肿瘤,如黑色素瘤,就不是。那些经历了上皮-间质转化的肿瘤,也不是,赛默飞世尔的肿瘤产品主管Jason Johnson谈道。
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