PCR技术服务

PCR技术服务，Q-PCR技术服务，RT-PCR实验代做

南京广东会总区生物提供 PCR实验代测，实时荧光定量PCR实验代测，RT-PCR代测。客户只需要提供样本，其他所有试剂都由本公司提供。一般7-10天出结果，提供原始数据，分析数据，实验报告，实验室所用仪器型号，图片，动力扩增曲线等。代测费用原价150元，现在6.2折*，！
 
Real -Time PCR，即实时监测PCR扩增产物并进行解析的方法，它是在PCR反应体系中加入荧光物质，并通过Real -Time PCR检测系统对PCR反应进程中的荧光信号强度进行实时监测，zui终对实验数据进行分析处理的方法。Real -Time PCR自1996年由美国Applied Biosystems公司推出以来，广泛应用于生物研究的各个领域。目前主要有SYBR Green 染料、Taqman探针法两种。
 
PCR实验代测，荧光定量PCR代测服主要仪器及耗材
旋涡振荡器 ：上海青浦泸西仪器厂产品
手握式电动匀浆机：德国FLUKO 公司产品
低温冷冻离心机：Sigma（3K15）公司产品
Real-time检测仪：ABI （ABI-7300）公司产品
超纯水分离系统：美国LABCONCO公司
离心管及10μL、200μL、1000μL枪头等常规耗材均为国产；RNA提取过程中所需的离心管、枪头等耗材经过0.1%的DEPC水浸泡过夜，121℃灭菌30min，烘干后备用。
 
PCR实验代测，荧光定量PCR代测服实验室试剂的操作
1)所用的所有溶液都应该没有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)污染。
2)所有PCR试剂中使用的水都应该是高质量的-新鲜蒸馏的去离子水，用0.22μm过滤的，并且是高压灭菌。
3)在20℃到25℃贮存的试剂建议加点像叠氮钠一类的抗微生物剂，在扩增试剂或样品制备试剂中加入0.025%的叠氮钠不抑制扩增反应。
4)所用试剂都应该以大体积配制，实验一下看试剂是否满意，然后分装成仅够一次使用的量进行贮存。
5)所有试剂和样品准备过程中都要使用一次性灭菌的瓶子和管子。
6)新配制的试剂在用于准备新的标本之前应该加以检验。
7)样品准备和前PCR区所使用的移液管在不使用时都应该小心保存。

本程序适用于自动PCR操作，可适用于大多数情况，所用酶是不含核酸外切酶活性的热稳定聚合酶，如Taq聚合酶等。 
引物（各50pmol） 0.2mmol/L dNTPs（必须使用高质量的dNTPs，这一点非常重要。dNTPs经反复化冻后会发生降解，因此应分成小份保存。应注意混合物中四种dNTP的量要相等） 模板DNA：约0.05～1mg基因组DNA或0.002～0.02mg质粒DNA Taq DNA聚合酶（Perkin Elmer, Norwalk, Connecticut） 10×PCR缓冲液（500mmol/L KCl，15mmol /L MgCl₂，100mmol/L Tris·HCl，pH 8.3） 矿物油 
电泳所需试剂 
【仪器设备】 
PCR扩增仪 
电泳装置 
微量离心机 
微量移液器（1～20ml和20～200ml） 
0.5ml Eppendorf 管 
紫外线观察装置及照相设备

 操作程序 

1．在无菌的Eppendorf管内加入以下反应物：

2．93℃ 反应2 min后开始以下循环： 
93℃变性反应1 min； 
50℃退火反应1 min； 
72℃延伸反应3 min。 
经过17～35循环后，zui后一个循环72℃增加5 min。循环结束后反应产物置于40℃保存。 
3．取1～5ml反应产物走凝胶电泳，经溴化乙锭染色检测扩增的情况。

，Q-，RT-PCR实验代做

应注意的问题及其解决方法 

1．PCR反应条件的优化 
要优化特定的PCR反应，有必要试用不同的反应组分和循环参数。表2-1列出了添加或改变某一试剂浓度对反应结果的影响，从中大家可以得到一些线索以改进反应条件，提高PCR产量和/或特异性，一般情况下，只须改变一两个参数就行了，如pH值和MgCl₂浓度。表2-2给出了循环参数对PCR结果的影响。 
表2-1 PCR各反应组分浓度对产物特异性和产量的影响

* 效果可能不可预测
** 添加10% DMSO时，Taq DNA聚合酶的活性会被抑制47%，因此反应加大Taq DNA聚合酶的用量（即5U）予以补偿
*** Perkin Elmer, Norwalk, Connecticut
表2-2 可改变以提高PCR产物的特异性和/或产量的循环参数

* 使用基因组DNA作模板时，开始几个循环变性应于97℃进行 
** 假定Tm值为60℃ 
*** 延伸时间依产物大小而定：1000bp的产物延伸30s即可，产物更长时，按每1000 bp延伸0.5 min计，在后期循环中增加延伸时间可以提高扩增效率
2．引物的设计 
毫无疑问，引物的碱基组成，长度及其靶序列的同源性是决定PCR成败的首要因素，选择设计引物在一定程度上仍然要靠经验，对于某一对引物而言尚无通用的规则可严，但应遵守以下原则： 
（1）一般性原则： 
①长度：15～30bp，其有效长度 [Ln=2 (G+C)+(A+T)] 一般不大于38，否则PCR的zui适延伸温度会超过Taq酶的作用温度（74℃），从而降低产物的特异性。 
②G＋C含量：应在45%～55%之间，PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm值减去5～10度。引物长度小于20时，其Tm值等于4×(G+C)+2×(A+T)。 
③ 碱基分布的随机性：应避免连续出现4个以上的单一碱基。尤其是不应在其3’端出现3个的连续的G或C，否则会使引物在G＋C富集序列区错误引发。 
④ 引物自身：不能含有自身互补序列，否则会形成发夹样二级结构。 
⑤引物之间：两个引物之间不应有多于4个的互补或同源碱基，不然会形成引物二聚体，尤应避免3’端的互补重叠。 
⑥特异性：与非特异扩增序列的同源性应小于70%，或少于连续8个的互补碱基。 
（2）引物的3’端： 
引物的3’端很大程度上影响Taq酶的延伸效应，除特殊情况（AS-PCR）外，3’端不应发生错配。S. Kwok等发现，引物的3’端发生错配时，A:A使产量下降至1/20，A:G或C:C下降至1/100。当末位碱基是T时，即使错配也能引发链的合成，而为A时错配的引发效率zui低，G、C居间。 
因此，引物的3’端碱基选用A、G、C，而尽可能地避免选用T，尤应避免连续出现2个以上的T。 
此外，如果扩增编码区域，引物的3’端不要终止于密码子的第3位，因此处易发生简并，从而影响扩增特异性。 
（3）避开引物的二级结构区： 
某些引物无效的原因是引物重复区二级结构的影响，因此选择扩增片段时应注意避开二级结构区，有些计算机软件可帮助确定该区域，如不能避开，则可用7- deaza-2’-脱氧GTP取代dGTP，有助于PCR成功。 
目前在引物选择中已广泛应用计算机软件，从EMBL或Genebank中查找有关基因序列，并依据上述原则对所选用引物进行评价。 
3．出现异常结果时的解决思路 
在做PCR反应的过程中，由于其酶促反应的本质，影响zui终结果的因素较多，所以出现一些非预料的结果是可以理解的。下面简单地总结一下在PCR反应结果出现异常时我们应该采取的措施。 
（1）电泳检查没有 PCR产物 
a．需检查一下Taq DNA聚合酶是否失活，或是活性太低，还需查一下在加样过程中是否向体系中加过Taq DNA聚合酶； 
b．需检查一下所使用的引物，看其序列设计是否正确，是否碱基组成不平衡； 
c．需要检查一下PCR反应过程中模板是否变性充分，尤其在前几个循环中是否变性充分；可以适当地提高模板变性的温度或是适当延长变性的时间；  
d．需检查一下在PCR反应体系中是否有Taq DNA聚合酶的抑制剂，如SDS污染等等； 
e．需检查一下模板中是否有蛋白酶和核酸酶的污染，可以预先加热使之失活。 
（2）电泳检查出现引物二聚体区带 
a．需检查一下两个引物的3’端是否互补，或者是否有相类似的回文结构； 
b．需检查一下使用的引物是否太短，可以予以适当的延长； 
c．需检查模板的用量，模板以10－4个拷贝，模板太少会造成引物相对过量； 
d．适当地降低引物的浓度，引物浓度过高是出现引物二聚体的zui主要原因；  
e．循环次数太多也易形成引物二聚体，可以适当地减少循环数；  
f．可以将复性温度提高一些以减少引物二聚体形成。  
（3）电泳检测PCR产物呈片状（smear）  
a．需检查一下Taq DNA聚合酶的用量，适当地减少Taq酶的量有助于特异性条带扩增；  
b．可以提高反应的退火温度，或者直接采用两个温度的PCR（68℃退火和延伸，94℃模板变性）；  
c．适当地降低Mg ²⁺ 的浓度也可起到降低非特异性扩增可能性的作用；  
d．适当地减少反应退火的时间和延伸的时间；  
e．适当地减少循环次数也会有效果；  
f．可以尝试使用巢式引物PCR（nested primer PCR）。  
（4）电泳检测PCR产物出现其它非特异性条带  
a．需检查一下引物的3’端是否有连续排列的G或C；  
b．可以适当地提高退火温度或直接采用两步温度PCR方法进行扩增；  
c．可以降低Taq DNA聚合酶的用量，同时也降低引物的浓度；  
d．可以适当地减少退火所用的时间以及延伸反应的时间；  
e．可以适当地增加或减少一些Mg ²⁺ 浓度。  
4．假阳性  
实验中设立的阴性对照可提示有无假阳性结果出现。如果一次实验中的几个阴性对照中出现一个或几个阳性结果，提示本次实验中其它标本的检测结果可能有假阳性。造成假阳性的原因包括样品污染、扩增试剂污染、扩增产物交叉污染等。常见的污染来源包括实验室环境、加样器、操作中形成的喷雾、DNA抽提仪器、试剂及任何与扩增产物接触的东西。  
预防各种污染的措施主要有：（1）工作区隔离。（2）改进实验操作，如在加样过程中避免试剂飞溅、吸头离心管使用前高压处理、试剂分装成小份一次使用后弃去等。（3）操作程序合理化，如后加阳性对照等。  
交叉污染的处理方法包括：（1）在DNA模板和多聚酶加入前，紫外线照射反应管内容物以破坏污染的PCR产物。一般选用波长254nm照射30min（Nature, 1990, 34:27）。（2）PCR实验中使用dUTP，而不用dTTP。在扩增前使用UraciⅠN-glycosylase（糖基化酶）处理可降解交叉污染的PCR产物，而不降解基因组DNA模板，然后热灭活此酶，再进行扩增反应（Gene, 1990, 93: 125）。美国PE公司提供此类试剂盒（PCR carry-over preventionkit）。（3）在PCR反应前加入一种光化学试剂，反应完成后激活该试剂，光化学试剂可交联 DNA链，使之不能再扩增（Nucleic Acids Res, 1991, 19: 99）。  
2.2.2.5 PCR技术在分子生药学中的应用  
对于生药学家来说，PCR技术已称为他们研究生药的一种崭新而有力的工具。PCR技术在生药学中的应用主要有两方面：①扩增和直接测序或者对属性特异的DNA序列定性以用于系统发育或亲缘关系的分析，也可用于鉴定品种；②通过简单纯化从复杂生物样品的混合物中鉴定病原体和土壤微生物，用于药用植物的基因工程。

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